个人信息 |
姓名: 宣佳佳 部门: 生命科学技术学院 性别: 女 职务: 职称: 讲师(高校) 学位: 博士 毕业院校: 中山大学 联系电话: 电子邮箱: xuanjj@jnu.edu.cn 办公地址: 第二理工楼902B 通讯地址: 广州市天河区黄埔大道西601暨南大学第二理工楼902B 邮编: 传真: 荣誉奖励: |
联系方式电子邮箱:xuanjj@jnu.edu.cn 办公地址:暨南大学石牌校区第二理工楼902B |
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个人简介宣佳佳,硕士研究生导师,暨南大学青年拔尖人才(“青蓝学者”)。2022年毕业于中山大学,获博士学位,被评为中山大学博士研究生优秀毕业生。目前研究方向主要为肿瘤的表观遗传调控和大数据挖掘。长期致力于RNA表观遗传修饰的鉴定和功能研究,具有丰富的转录组(RNA-seq)、RNA结合蛋白靶标组(CLIP-seq)、翻译组(Ribo-seq)等数据挖掘经验及算法开发经验,在表观遗传修饰、非编码RNA调控网络及RNA-RNA结合蛋白互作网络等方面做出一系列创新性成果,成功开发了RMBase、Pol3Base、deepBase、ChIPBase和starBase平台,解析了TP53诱导的lncRNA编码功能性多肽的机制及其抑制细胞增殖的功能。在国际Top期刊上发表多篇SCI论文,其中RMBase单篇引用超过340次。 学习经历 2022年:中山大学博士学位,中山大学博士研究生优秀毕业生 2018年:中山大学硕士学位 工作经历2022年-至今:暨南大学生命科学技术学院,助理研究员 研究方向① RNA表观遗传修饰; ② 非编码RNA的表达和调控网络; ③ 肿瘤的表观遗传调控和大数据挖掘 ④ 铜死亡 主要论文1. Xuan J, Chen L, Chen Z, Pang J, Huang J, Lin J, Zheng L, Li B, Qu L, Yang J. RMBase v3.0: decode the landscape, mechanisms and functions of RNA modifications. Nucleic Acids Res. 2024 Jan 5;52(D1):D273-D284. doi: 10.1093/nar/gkad1070. 2. Xuan JJ, Sun WJ, Lin PH, Zhou KR, Liu S, Zheng LL, Qu LH, Yang JH. RMBase v2.0: deciphering the map of RNA modifications from epitranscriptome sequencing data. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D327-D334. doi: 10.1093/nar/gkx934. 3. Cai L, Xuan J, Lin Q, Wang J, Liu S, Xie F, Zheng L, Li B, Qu L, Yang J. Pol3Base: a resource for decoding the interactome, expression, evolution, epitranscriptome and disease variations of Pol III-transcribed ncRNAs. Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D279-D286. doi: 10.1093/nar/gkab1033. 4. Xie F, Liu S, Wang J, Xuan J, Zhang X, Qu L, Zheng L, Yang J. deepBase v3.0: expression atlas and interactive analysis of ncRNAs from thousands of deep-sequencing data. Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D877-D883. doi: 10.1093/nar/gkaa1039. 5. Huang J, Zheng W, Zhang P, Lin Q, Chen Z, Xuan J, Liu C, Wu D, Huang Q, Zheng L, Liu S, Zhou K, Qu L, Li B, Yang J. ChIPBase v3.0: the encyclopedia of transcriptional regulations of non-coding RNAs and protein-coding genes. Nucleic Acids Res. 2023 Jan 6;51(D1):D46-D56. doi: 10.1093/nar/gkac1067. 6. Xu W, Liu C, Deng B, Lin P, Sun Z, Liu A, Xuan J, Li Y, Zhou K, Zhang X, Huang Q, Zhou H, He Q, Li B, Qu L, Yang J. TP53-inducible putative long noncoding RNAs encode functional polypeptides that suppress cell proliferation. Genome Res. 2022 Jun;32(6):1026-1041. doi: 10.1101/gr.275831.121. Epub 2022 May 24. 主要著作承担课题① 中央高校基本科研业务经费项目,RNA修饰蛋白图谱的构建及其在人类癌症中的驱动作用,2023/1—2024/12,在研, 主持。 ② 基础与应用基础研究专题项目,青年博士启航项目, 基于高通量测序数据开发标准化算法用于精确鉴定和定量RNA修饰并解析它们的空间特异性和时间特异性,2024/1-2025/12,在研, 主持。 ③国家自然科学基金委员会, 面上项目, m6A读码器IGF2BP2调控TJP1可变剪接促进肝癌细胞上皮间质转化及转移, 2022-01-01 至 2025-12-31, 在研, 参与。 发明专利讲授课程① 功能蛋白研究(研究生) ② 生物信息学(研究生) ③ 基因组学(本科生) ④ 生物化学与分子生物学(本科生) 荣誉奖励社会职务 |